MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC03

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015421	A	6	6	152	157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015421	A	6	6	234	239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015421	TAG	2	6	268	273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015421	TTTTA	2	10	290	299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015421	A	6	6	311	316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015421	CAAG	2	8	334	341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015421	CT	3	6	446	451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015421	CAAA	2	8	500	507	75 %	0 %	0 %	25 %	330370667
9	NC_015421	TTC	2	6	548	553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370667
10	NC_015421	AGCT	2	8	612	619	25 %	25 %	25 %	25 %	330370667
11	NC_015421	TGA	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370667
12	NC_015421	AGC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
13	NC_015421	A	6	6	758	763	100 %	0 %	0 %	0 %	330370667
14	NC_015421	ACT	2	6	781	786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
15	NC_015421	GAC	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
16	NC_015421	TA	3	6	1077	1082	50 %	50 %	0 %	0 %	330370667
17	NC_015421	AGA	2	6	1162	1167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370667
18	NC_015421	CTT	2	6	1210	1215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370667
19	NC_015421	TGA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370667
20	NC_015421	CAA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370667
21	NC_015421	GCG	2	6	1303	1308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330370667
22	NC_015421	ATC	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
23	NC_015421	GAC	2	6	1385	1390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
24	NC_015421	GAA	2	6	1391	1396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370667
25	NC_015421	TGA	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370667
26	NC_015421	AAG	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370667
27	NC_015421	ACT	2	6	1479	1484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
28	NC_015421	A	6	6	1526	1531	100 %	0 %	0 %	0 %	330370667
29	NC_015421	TCA	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
30	NC_015421	AGC	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
31	NC_015421	TA	3	6	1634	1639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015421	ACAA	2	8	1671	1678	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015421	T	7	7	1799	1805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015421	T	6	6	1830	1835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015421	AGG	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015421	A	7	7	1891	1897	100 %	0 %	0 %	0 %	330370668
37	NC_015421	TTAT	2	8	1917	1924	25 %	75 %	0 %	0 %	330370668
38	NC_015421	ATT	2	6	1956	1961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370668
39	NC_015421	TGATT	2	10	1977	1986	20 %	60 %	20 %	0 %	330370668
40	NC_015421	TAT	2	6	2025	2030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370668
41	NC_015421	CAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370669
42	NC_015421	AATT	2	8	2138	2145	50 %	50 %	0 %	0 %	330370669
43	NC_015421	TCT	2	6	2207	2212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370669
44	NC_015421	A	7	7	2358	2364	100 %	0 %	0 %	0 %	330370669
45	NC_015421	TAT	2	6	2414	2419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370669
46	NC_015421	CTG	2	6	2452	2457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370669
47	NC_015421	ACG	2	6	2470	2475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370669
48	NC_015421	CATGC	2	10	2601	2610	20 %	20 %	20 %	40 %	330370669
49	NC_015421	TGG	2	6	2642	2647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370669
50	NC_015421	ACC	2	6	2826	2831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370669
51	NC_015421	CTT	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015421	A	6	6	2914	2919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015421	AT	4	8	2931	2938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015421	TGT	2	6	2992	2997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015421	TAA	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015421	TAT	2	6	3046	3051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015421	GT	3	6	3061	3066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015421	GTG	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015421	CAG	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015421	TAT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015421	A	7	7	3242	3248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015421	ATCA	2	8	3292	3299	50 %	25 %	0 %	25 %	330370670
63	NC_015421	GCG	2	6	3399	3404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330370670
64	NC_015421	TGA	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370670
65	NC_015421	AAT	2	6	3518	3523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370670
66	NC_015421	GT	3	6	3532	3537	0 %	50 %	50 %	0 %	330370670
67	NC_015421	T	6	6	3537	3542	0 %	100 %	0 %	0 %	330370670
68	NC_015421	TTG	2	6	3553	3558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370670
69	NC_015421	ATC	2	6	3604	3609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370670
70	NC_015421	TTG	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370670
71	NC_015421	CCT	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330370671
72	NC_015421	AATC	2	8	3669	3676	50 %	25 %	0 %	25 %	330370671
73	NC_015421	TAAT	2	8	3839	3846	50 %	50 %	0 %	0 %	330370671
74	NC_015421	GGAA	2	8	3922	3929	50 %	0 %	50 %	0 %	330370671
75	NC_015421	GTT	2	6	4177	4182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370671
76	NC_015421	TTG	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370671
77	NC_015421	A	6	6	4263	4268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015421	GGT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015421	A	7	7	4366	4372	100 %	0 %	0 %	0 %	330370672
80	NC_015421	GACGAA	2	12	4391	4402	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330370672
81	NC_015421	A	6	6	4455	4460	100 %	0 %	0 %	0 %	330370672
82	NC_015421	AAG	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370672
83	NC_015421	TTAA	2	8	4529	4536	50 %	50 %	0 %	0 %	330370672
84	NC_015421	TTG	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370672
85	NC_015421	GAT	3	9	4574	4582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370672
86	NC_015421	A	6	6	4606	4611	100 %	0 %	0 %	0 %	330370673
87	NC_015421	TAT	2	6	4677	4682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370673
88	NC_015421	TGA	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370673
89	NC_015421	AGC	2	6	4695	4700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370673
90	NC_015421	CAA	3	9	4720	4728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370673
91	NC_015421	ACC	2	6	4731	4736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370673
92	NC_015421	AAAAC	2	10	4808	4817	80 %	0 %	0 %	20 %	330370673
93	NC_015421	TGG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370673
94	NC_015421	A	6	6	4944	4949	100 %	0 %	0 %	0 %	330370673
95	NC_015421	AGA	2	6	4958	4963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370673
96	NC_015421	ATAA	2	8	4985	4992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015421	TAT	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015421	TTAT	2	8	5024	5031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015421	T	6	6	5124	5129	0 %	100 %	0 %	0 %	330370674
100	NC_015421	TTTTTC	2	12	5142	5153	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	330370674
101	NC_015421	TGG	2	6	5208	5213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370674
102	NC_015421	ATTAG	2	10	5257	5266	40 %	40 %	20 %	0 %	330370674
103	NC_015421	ATCA	2	8	5286	5293	50 %	25 %	0 %	25 %	330370674
104	NC_015421	CTG	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370674
105	NC_015421	TCT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370674
106	NC_015421	GGAA	2	8	5403	5410	50 %	0 %	50 %	0 %	330370674
107	NC_015421	T	7	7	5477	5483	0 %	100 %	0 %	0 %	330370674
108	NC_015421	TAAT	2	8	5500	5507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015421	GTA	2	6	5549	5554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015421	CCAA	2	8	5562	5569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015421	GTC	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370675
112	NC_015421	GCA	2	6	5803	5808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370675
113	NC_015421	TGGC	2	8	5913	5920	0 %	25 %	50 %	25 %	330370675
114	NC_015421	AAC	2	6	6014	6019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370675
115	NC_015421	CAA	2	6	6023	6028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370675
116	NC_015421	CCAT	2	8	6309	6316	25 %	25 %	0 %	50 %	330370675
117	NC_015421	TTC	2	6	6370	6375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370675
118	NC_015421	TGA	2	6	6408	6413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370675
119	NC_015421	AGC	2	6	6420	6425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370675
120	NC_015421	TAAT	2	8	6434	6441	50 %	50 %	0 %	0 %	330370675
121	NC_015421	CAT	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370675
122	NC_015421	ATA	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015421	TAA	2	6	6577	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015421	GCA	2	6	6620	6625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015421	TTA	2	6	6686	6691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015421	GAA	2	6	6766	6771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015421	TAA	2	6	6790	6795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015421	ACT	2	6	6833	6838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015421	ACT	2	6	6863	6868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015421	AGT	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015421	ATAA	2	8	7000	7007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015421	TAA	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015421	CTA	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015421	CAG	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015421	TTA	2	6	7163	7168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015421	ATTC	2	8	7179	7186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015421	CA	3	6	7187	7192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015421	GTG	2	6	7386	7391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015421	CTATTG	2	12	7413	7424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_015421	TGT	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015421	ATTA	2	8	7453	7460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015421	TAA	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015421	AAG	2	6	7526	7531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015421	TGG	2	6	7589	7594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370676
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155	NC_015421	ATGA	2	8	8402	8409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015421	ATA	2	6	8429	8434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015421	A	6	6	8474	8479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_015421	T	6	6	8887	8892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015421	TAT	2	6	8895	8900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015421	CAG	2	6	8909	8914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_015421	TGC	2	6	9130	9135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_015421	TGG	2	6	9162	9167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015421	T	7	7	9232	9238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_015421	AAC	2	6	9272	9277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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187	NC_015421	AT	3	6	9673	9678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015421	ATAA	2	8	9700	9707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_015421	TGG	2	6	9762	9767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370679
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193	NC_015421	T	7	7	9959	9965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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213	NC_015421	T	6	6	10726	10731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.